Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
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