Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCBE1Q6UXH8 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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