Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GEN1Q17RS7 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms