Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
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PTPROQ16827 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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PTPROQ16827 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
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PTPROQ16827 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
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PTPROQ16827 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
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PTPROQ16827 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
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PTPROQ16827 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
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PTPROQ16827 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
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PTPROQ16827 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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PTPROQ16827 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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PTPROQ16827 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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