Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
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SEC23AQ15436 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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SEC23AQ15436 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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SEC23AQ15436 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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SEC23AQ15436 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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SEC23AQ15436 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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SEC23AQ15436 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
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SEC23AQ15436 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
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SEC23AQ15436 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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SEC23AQ15436 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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SEC23AQ15436 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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SEC23AQ15436 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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SEC23AQ15436 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEC23AQ15436 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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