Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
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COL19A1Q14993 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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COL19A1Q14993 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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COL19A1Q14993 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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COL19A1Q14993 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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COL19A1Q14993 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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