Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
RFTN1Q14699 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RFTN1Q14699 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms