Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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