Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CDH18Q13634 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CDH18Q13634 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDH18Q13634 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDH18Q13634 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDH18Q13634 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDH18Q13634 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDH18Q13634 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDH18Q13634 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDH18Q13634 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDH18Q13634 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDH18Q13634 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDH18Q13634 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDH18Q13634 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDH18Q13634 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDH18Q13634 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDH18Q13634 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDH18Q13634 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDH18Q13634 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDH18Q13634 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDH18Q13634 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CDH18Q13634 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CDH18Q13634 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.3 ms