Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms