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| NAE1 | Q13564 | RNU6-1280P-201 | ENST00000365211 | 107 nt | BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-8-201 | ENST00000365467 | 107 nt | BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
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| NAE1 | Q13564 | RNU6-1-201 | ENST00000383898 | 107 nt | BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.414-201 | ENST00000384011 | 101 nt | BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
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| NAE1 | Q13564 | AC021646.1-201 | ENST00000605469 | 484 nt | BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
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| NAE1 | Q13564 | AC011890.2-201 | ENST00000613393 | 294 nt | BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
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| NAE1 | Q13564 | DLEU2_6.2-201 | ENST00000620994 | 136 nt | BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | PRKACB-207 | ENST00000394838 | 4294 nt | TSL 5 BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | ADGRG7-202 | ENST00000475887 | 2035 nt | TSL 2 BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | IL23R-205 | ENST00000637002 | 2208 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | CUL3-203 | ENST00000409096 | 2701 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | DCUN1D1-208 | ENST00000632685 | 3147 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | TBC1D31-214 | ENST00000522420 | 3167 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | SHOC2-201 | ENST00000265277 | 3691 nt | TSL 2 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | MLF1-203 | ENST00000392822 | 2157 nt | TSL 5 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | ZNF479-202 | ENST00000331162 | 2072 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | ANKAR-209 | ENST00000520309 | 4410 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNHG14-215 | ENST00000551631 | 4008 nt | TSL 5 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC138393.1-203 | ENST00000327086 | 343 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNORA32.2-201 | ENST00000384049 | 122 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNY3P14-201 | ENST00000384309 | 102 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-831P-201 | ENST00000384548 | 107 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC010967.2-201 | ENST00000418451 | 333 nt | TSL 2 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL139281.1-201 | ENST00000422120 | 335 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
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| NAE1 | Q13564 | AL139397.1-201 | ENST00000430456 | 644 nt | TSL 2 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
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| NAE1 | Q13564 | AC010974.1-201 | ENST00000450509 | 374 nt | TSL 3 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC019155.3-201 | ENST00000454957 | 600 nt | TSL 2 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC096733.1-201 | ENST00000503844 | 402 nt | TSL 3 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
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| NAE1 | Q13564 | AC087854.1-201 | ENST00000519706 | 414 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC091944.1-201 | ENST00000521984 | 449 nt | TSL 3 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
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| NAE1 | Q13564 | AC020895.1-201 | ENST00000595362 | 272 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC008121.1-201 | ENST00000603244 | 268 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC091152.3-201 | ENST00000604227 | 325 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL627309.6-201 | ENST00000606857 | 840 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | FAM157A-202 | ENST00000615155 | 405 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | CCDC178-213 | ENST00000583930 | 3094 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | MYOT-201 | ENST00000239926 | 2337 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | LTN1-201 | ENST00000361371 | 7685 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC108750.1-201 | ENST00000637986 | 2706 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | FTX-214 | ENST00000638437 | 12267 nt | TSL 5 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | SLC30A6-202 | ENST00000357055 | 4758 nt | TSL 2 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | LCOR-205 | ENST00000421806 | 16004 nt | TSL 3 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-1252P-201 | ENST00000363054 | 104 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-851P-201 | ENST00000384565 | 107 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR491-201 | ENST00000384877 | 84 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNORA48.5-201 | ENST00000391143 | 135 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR450B-201 | ENST00000401182 | 78 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | FTH1P15-201 | ENST00000406984 | 280 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNORD56-201 | ENST00000413522 | 71 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL451074.5-201 | ENST00000415894 | 435 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | MTND4LP11-201 | ENST00000422184 | 280 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC007566.1-201 | ENST00000427458 | 643 nt | TSL 5 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL157937.1-201 | ENST00000435092 | 443 nt | TSL 3 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL590999.1-206 | ENST00000437947 | 436 nt | TSL 3 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | RPL7P12-201 | ENST00000446719 | 750 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC013727.2-201 | ENST00000447761 | 545 nt | TSL 4 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| NAE1 | Q13564 | MTND3P10-201 | ENST00000450967 | 341 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |