Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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