Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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