Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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