Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PMS2P3Q13401 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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