Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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