Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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