Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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