Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms