Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.8 ms