Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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