Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMOD3Q9NYL9 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms