Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140 ms