Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf140Q5VVS0 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
C1orf140Q5VVS0 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.4 ms