Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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