Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FXNQ16595 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FXNQ16595 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FXNQ16595 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FXNQ16595 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
FXNQ16595 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
FXNQ16595 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FXNQ16595 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
FXNQ16595 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
FXNQ16595 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FXNQ16595 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FXNQ16595 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FXNQ16595 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FXNQ16595 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FXNQ16595 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FXNQ16595 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FXNQ16595 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FXNQ16595 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FXNQ16595 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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FXNQ16595 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FXNQ16595 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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FXNQ16595 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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FXNQ16595 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FXNQ16595 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FXNQ16595 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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FXNQ16595 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FXNQ16595 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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FXNQ16595 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FXNQ16595 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FXNQ16595 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FXNQ16595 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FXNQ16595 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FXNQ16595 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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FXNQ16595 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FXNQ16595 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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FXNQ16595 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
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FXNQ16595 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
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FXNQ16595 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FXNQ16595 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
FXNQ16595 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FXNQ16595 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
FXNQ16595 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FXNQ16595 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FXNQ16595 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FXNQ16595 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
FXNQ16595 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FXNQ16595 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FXNQ16595 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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