Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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SGCBQ16585 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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SGCBQ16585 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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SGCBQ16585 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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SGCBQ16585 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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SGCBQ16585 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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