Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.8 ms