Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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SIX1Q15475 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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SIX1Q15475 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
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SIX1Q15475 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
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SIX1Q15475 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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SIX1Q15475 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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SIX1Q15475 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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SIX1Q15475 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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