Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC0.4□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.34
SHPRHQ149N8 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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SHPRHQ149N8 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SHPRHQ149N8 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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