Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.1 ms