Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms