Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGB1Q14028 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGB1Q14028 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGB1Q14028 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGB1Q14028 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGB1Q14028 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CNGB1Q14028 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms