Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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PTCH1Q13635 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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PTCH1Q13635 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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PTCH1Q13635 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
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PTCH1Q13635 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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PTCH1Q13635 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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