Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4BQ13620 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms