Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CUL3Q13618 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL3Q13618 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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CUL3Q13618 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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