Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms