Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMAD4Q13485 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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