Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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