Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SF3B2Q13435 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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