Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
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