Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NME3Q13232 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NME3Q13232 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NME3Q13232 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NME3Q13232 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NME3Q13232 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NME3Q13232 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NME3Q13232 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NME3Q13232 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NME3Q13232 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NME3Q13232 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NME3Q13232 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NME3Q13232 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NME3Q13232 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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NME3Q13232 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NME3Q13232 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NME3Q13232 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NME3Q13232 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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NME3Q13232 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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NME3Q13232 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NME3Q13232 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NME3Q13232 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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NME3Q13232 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NME3Q13232 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NME3Q13232 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NME3Q13232 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NME3Q13232 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NME3Q13232 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NME3Q13232 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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