Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3BQ13214 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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