Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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NR1H3Q13133 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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NR1H3Q13133 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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NR1H3Q13133 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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NR1H3Q13133 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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NR1H3Q13133 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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