Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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