Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTP4A2Q12974 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms