Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.4 ms