Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TMPOP42166 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TMPOP42166 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TMPOP42166 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
TMPOP42166 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TMPOP42166 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TMPOP42166 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TMPOP42166 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
TMPOP42166 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TMPOP42166 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TMPOP42166 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TMPOP42166 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TMPOP42166 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TMPOP42166 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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