Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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PTPRDP23468 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
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PTPRDP23468 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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PTPRDP23468 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
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PTPRDP23468 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
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PTPRDP23468 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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PTPRDP23468 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC0.76□□□□□ -2.29
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