Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRAP18433 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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